在雙流式機械過濾器中，進水分為兩路，一路由上部進入，另一路由下部進入。經過過濾的出水都由中部流出。這樣由上部進入的水，其過濾機理與單流式機械過濾器相同，主要是濾層的“薄膜過濾”；而由下部進入的水，由于首先接觸的是顆粒大的濾料，然后接觸的是顆粒逐漸減小的濾料，其過濾機理主要是“滲透過濾”。這樣，濾料的截污能力就可以比較充分地發揮出來。
    所以，雙流式機械過濾器的內部結構，與單流式的有所不同：一是中部設有排水裝置；同時其濾層也較高，在中間排水裝置以上的濾層高0.7m，中排以下的濾層為1.7m。
    另外，雙流式機械過濾器所用的濾料也較單流式的大。如采用石英砂，其濾料粒徑為0.4 -1.5mm，不均勻系數為2.5-3.0。
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